MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfitobacterium hafniense Y51 chromosome

Total Repeats: 92748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007907	CCT	2	6	102	107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89892747
2	NC_007907	CAT	2	6	186	191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89892747
3	NC_007907	ATCC	2	8	207	214	25 %	25 %	0 %	50 %	89892747
4	NC_007907	ACA	2	6	262	267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89892747
5	NC_007907	TCT	2	6	295	300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89892747
6	NC_007907	GCC	3	9	394	402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89892747
7	NC_007907	TTAT	2	8	442	449	25 %	75 %	0 %	0 %	89892747
8	NC_007907	ATCC	2	8	576	583	25 %	25 %	0 %	50 %	89892747
9	NC_007907	TTGA	2	8	637	644	25 %	50 %	25 %	0 %	89892747
10	NC_007907	AAG	2	6	668	673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89892747
11	NC_007907	AGG	2	6	680	685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89892747
12	NC_007907	TTC	2	6	688	693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89892747
13	NC_007907	ATG	2	6	713	718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89892747
14	NC_007907	ATT	3	9	730	738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89892747
15	NC_007907	TCC	2	6	739	744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89892747
16	NC_007907	TCC	2	6	750	755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89892747
17	NC_007907	CCG	2	6	826	831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89892747
18	NC_007907	A	7	7	861	867	100 %	0 %	0 %	0 %	89892747
19	NC_007907	AG	3	6	940	945	50 %	0 %	50 %	0 %	89892747
20	NC_007907	ATT	2	6	1036	1041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89892747
21	NC_007907	TGA	2	6	1221	1226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89892747
22	NC_007907	GGA	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89892747
23	NC_007907	ACC	2	6	1246	1251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89892747
24	NC_007907	GCC	2	6	1283	1288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89892747
25	NC_007907	T	6	6	1585	1590	0 %	100 %	0 %	0 %	89892748
26	NC_007907	GAG	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89892748
27	NC_007907	GCT	2	6	1597	1602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89892748
28	NC_007907	CGT	2	6	1770	1775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89892748
29	NC_007907	TTC	2	6	1808	1813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89892748
30	NC_007907	T	6	6	1823	1828	0 %	100 %	0 %	0 %	89892748
31	NC_007907	CATT	2	8	1893	1900	25 %	50 %	0 %	25 %	89892748
32	NC_007907	GGA	2	6	1938	1943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89892748
33	NC_007907	TTA	2	6	1951	1956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89892748
34	NC_007907	CTG	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89892748
35	NC_007907	AG	3	6	2046	2051	50 %	0 %	50 %	0 %	89892748
36	NC_007907	CTGC	2	8	2070	2077	0 %	25 %	25 %	50 %	89892748
37	NC_007907	TAT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89892748
38	NC_007907	GATGAG	2	12	2227	2238	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	89892748
39	NC_007907	TCTCC	2	10	2295	2304	0 %	40 %	0 %	60 %	89892748
40	NC_007907	TTGA	2	8	2308	2315	25 %	50 %	25 %	0 %	89892748
41	NC_007907	TAT	2	6	2372	2377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89892748
42	NC_007907	CTT	2	6	2411	2416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89892748
43	NC_007907	TAT	2	6	2445	2450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89892748
44	NC_007907	AG	3	6	2469	2474	50 %	0 %	50 %	0 %	89892748
45	NC_007907	A	7	7	2529	2535	100 %	0 %	0 %	0 %	89892748
46	NC_007907	ATT	2	6	2593	2598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89892748
47	NC_007907	CGA	2	6	2661	2666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89892748
48	NC_007907	CTATCT	2	12	2673	2684	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	89892748
49	NC_007907	ATCAGG	2	12	2764	2775	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89892749
50	NC_007907	TATT	2	8	2849	2856	25 %	75 %	0 %	0 %	89892749
51	NC_007907	GA	3	6	2914	2919	50 %	0 %	50 %	0 %	89892749
52	NC_007907	GCG	2	6	2954	2959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89892749
53	NC_007907	ATT	2	6	3000	3005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89892749
54	NC_007907	ATCA	2	8	3009	3016	50 %	25 %	0 %	25 %	89892749
55	NC_007907	T	9	9	3064	3072	0 %	100 %	0 %	0 %	89892749
56	NC_007907	CAC	2	6	3147	3152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89892749
57	NC_007907	A	7	7	3199	3205	100 %	0 %	0 %	0 %	89892749
58	NC_007907	CCT	2	6	3209	3214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89892749
59	NC_007907	ACAGGG	2	12	3218	3229	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	89892749
60	NC_007907	TCC	2	6	3277	3282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89892749
61	NC_007907	TTC	2	6	3365	3370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89892749
62	NC_007907	AGA	2	6	3377	3382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89892749
63	NC_007907	A	6	6	3410	3415	100 %	0 %	0 %	0 %	89892749
64	NC_007907	GGA	2	6	3422	3427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89892749
65	NC_007907	TGGAAA	2	12	3472	3483	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	89892749
66	NC_007907	GAC	2	6	3513	3518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89892749
67	NC_007907	GCA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89892749
68	NC_007907	GAT	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89892749
69	NC_007907	GA	3	6	3689	3694	50 %	0 %	50 %	0 %	89892749
70	NC_007907	CTAT	2	8	3695	3702	25 %	50 %	0 %	25 %	89892749
71	NC_007907	CAA	2	6	3723	3728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89892749
72	NC_007907	ATGACC	2	12	3735	3746	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89892749
73	NC_007907	GGA	2	6	3808	3813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89892749
74	NC_007907	AAT	2	6	3817	3822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89892749
75	NC_007907	GGC	2	6	3840	3845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89892750
76	NC_007907	T	6	6	3923	3928	0 %	100 %	0 %	0 %	89892750
77	NC_007907	A	6	6	3949	3954	100 %	0 %	0 %	0 %	89892750
78	NC_007907	ATT	2	6	3993	3998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89892750
79	NC_007907	TCA	2	6	4029	4034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89892750
80	NC_007907	TTA	2	6	4041	4046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89892750
81	NC_007907	ATC	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89892750
82	NC_007907	GAA	2	6	4074	4079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89892750
83	NC_007907	CCAA	2	8	4267	4274	50 %	0 %	0 %	50 %	89892751
84	NC_007907	CAT	2	6	4372	4377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89892751
85	NC_007907	ATA	2	6	4397	4402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89892751
86	NC_007907	CGA	2	6	4407	4412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89892751
87	NC_007907	GTG	2	6	4474	4479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89892751
88	NC_007907	GGA	2	6	4564	4569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89892751
89	NC_007907	ATC	2	6	4685	4690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89892751
90	NC_007907	ACC	2	6	4762	4767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89892751
91	NC_007907	CTTT	2	8	4846	4853	0 %	75 %	0 %	25 %	89892751
92	NC_007907	AGA	2	6	4893	4898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89892751
93	NC_007907	AAGA	2	8	4900	4907	75 %	0 %	25 %	0 %	89892751
94	NC_007907	CGG	2	6	4923	4928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89892751
95	NC_007907	T	6	6	5063	5068	0 %	100 %	0 %	0 %	89892751
96	NC_007907	AAT	2	6	5077	5082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89892751
97	NC_007907	CCG	2	6	5225	5230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89892751
98	NC_007907	ACCAAG	2	12	5272	5283	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	89892751
99	NC_007907	TTCG	2	8	5300	5307	0 %	50 %	25 %	25 %	89892751
100	NC_007907	T	6	6	5344	5349	0 %	100 %	0 %	0 %	89892751
101	NC_007907	CCCGGG	2	12	5402	5413	0 %	0 %	50 %	50 %	89892751
102	NC_007907	AGC	2	6	5415	5420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89892751
103	NC_007907	AAG	2	6	5504	5509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89892751
104	NC_007907	CAAG	2	8	5562	5569	50 %	0 %	25 %	25 %	89892751
105	NC_007907	TCG	2	6	5577	5582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89892751
106	NC_007907	CCGATG	2	12	5753	5764	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	89892751
107	NC_007907	CTT	3	9	5799	5807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89892751
108	NC_007907	GAA	2	6	5874	5879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89892751
109	NC_007907	AATG	2	8	5985	5992	50 %	25 %	25 %	0 %	89892751
110	NC_007907	TGG	2	6	6104	6109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89892751
111	NC_007907	GGA	2	6	6200	6205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89892752
112	NC_007907	GGA	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89892752
113	NC_007907	A	6	6	6239	6244	100 %	0 %	0 %	0 %	89892752
114	NC_007907	ATT	2	6	6255	6260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89892752
115	NC_007907	CGC	2	6	6323	6328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89892752
116	NC_007907	TAA	2	6	6364	6369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89892752
117	NC_007907	ATG	2	6	6444	6449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89892752
118	NC_007907	AT	3	6	6583	6588	50 %	50 %	0 %	0 %	89892752
119	NC_007907	ATG	2	6	6633	6638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89892752
120	NC_007907	CGG	2	6	6699	6704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89892752
121	NC_007907	TCCC	2	8	6732	6739	0 %	25 %	0 %	75 %	89892752
122	NC_007907	CGAGAT	2	12	6790	6801	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	89892752
123	NC_007907	TGA	2	6	6810	6815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89892752
124	NC_007907	ACCGG	2	10	6885	6894	20 %	0 %	40 %	40 %	89892752
125	NC_007907	GAG	2	6	6932	6937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89892752
126	NC_007907	A	6	6	7011	7016	100 %	0 %	0 %	0 %	89892752
127	NC_007907	CGGAC	2	10	7074	7083	20 %	0 %	40 %	40 %	89892752
128	NC_007907	GAA	2	6	7166	7171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89892752
129	NC_007907	TCAT	2	8	7236	7243	25 %	50 %	0 %	25 %	89892752
130	NC_007907	TAT	2	6	7372	7377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89892752
131	NC_007907	TGA	2	6	7390	7395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89892752
132	NC_007907	A	6	6	7521	7526	100 %	0 %	0 %	0 %	89892752
133	NC_007907	ATT	2	6	7586	7591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89892752
134	NC_007907	GAT	2	6	7688	7693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89892752
135	NC_007907	GAA	2	6	7694	7699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89892752
136	NC_007907	TCA	2	6	7704	7709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89892752
137	NC_007907	TA	3	6	7727	7732	50 %	50 %	0 %	0 %	89892752
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